In vitro-Charakterisierung regulatorischer und sensorischer RNAs in Prokaryoten / von Nadja Heidrich

Im Rahmen dieser Arbeit wurden eine cis-kodierte und eine trans-kodierte Antisense-RNA aus Bacillus subtilis sowie eine RNA-Thermometerstruktur aus Salmonella enterica in vitro strukturell und funktionell charakterisiert. In vitro-Analysen zur inhibitorischen Wirkung der cis-kodierten Antisense-RNA RNAIII haben gezeigt, dass die Ausbildung einer vollständigen Duplex mit ihrer Target-RNA (RNAII) nicht erforderlich ist. Ein Bindungsintermediat, das lediglich die simultane Beteiligung der Stem-Loops L3 und L4 von RNAIII erfordert, reicht als inhibitorischer Komplex für die Regulation der Replikation des Streptokokkenplasmides pIP501 aus. SR1 aus Bacillus subtilis ist eine 205 nt lange trans-kodierte Antisense-RNA, die durch direkte Basenpaarung regulierend auf ihr Target, ahrC-mRNA, einwirken kann. SR1 induziert strukturelle Veränderungen stromabwärts der Ribosomenbindungsstelle von ahrC-mRNA, wodurch die Translationsinitiation von AhrC verhindert wird. Die Translationskontrolle des agsA-Transkriptes in Salmonella enterica erfolgt über eine RNA-Thermometer-Struktur, die keinem der bisher identifizierten RNA-Thermometertypen entspricht.

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Person: Heidrich, Nadja [Author]
Corporate Author: Friedrich-Schiller-Universität Jena [Degree granting institution]
Format: Book
Language(s):German
Publication:Jena, 2007
Printing place:Jena
Dissertation:Jena, Univ., Diss., 2007
Subjects:Heubacillus > Salmonella enterica > Antisense-RNS > Genexpression > Prokaryoten > Hitzestress > RNS-Polymerase III > Strukturanalyse > Streptococcus > Sekundärstruktur
Type of content:Hochschulschrift
Related resources:Erscheint auch als Online-Ausgabe: In vitro-Charakterisierung regulatorischer und sensorischer RNAs in Prokaryoten
Physical description:getr. Zählung : Ill., graph. Darst. ; 29,5 cm
Basic Classification: 42.13 Molekularbiologie
35.71 Biochemische Methoden
42.49 Prokaryota